亨利·戈尔丁饰演的蛇眼是一名背负着复杂过往的独行侠，在命运的牵引下，他偶然拯救了古老忍者组织“岚影一族”的继承者，并因此受邀踏入其位于日本的隐秘基地。在那里，蛇眼不仅接受了严格的忍者训练，更找到了渴望已久的归属与温暖。然而，随着昔日的秘密逐渐浮出水面，他的忠诚与信任都面临严峻考验，甚至可能失去最珍贵的情谊。与此同时，特种部队系列中的多位经典角色也将在本片中轮番登场，为《特种部队：蛇眼起源》注入丰富的情节张力。